国务院机关事务管理局幼儿园的前身是解放战争时期中央机关设在河北省李家庄的一所托儿所，1951年9月成立中央人民政府政务院幼儿园，隶属于政务院秘书厅，位于中南海紫光阁北侧的时应宫。1954年9月全国人大一次会议将政务院改称国务院后，幼儿园遂改称国务院幼儿园。
1959年，国务院幼儿园的行政隶属关系划归国管局，先后增加了复兴门幼儿园、东郊幼儿园和西郊幼儿园，对外统称国管局幼儿园。1983年，国管局幼儿园为退还柳荫街14号天主教爱国会原址，遂迁入海淀区花园村甲1号的新建幼儿园至今。2009年9月国管局幼儿园广源分部成立，国管局幼儿园在发展历程中又迈出了坚实的一步。
特别是2004年"六·一"儿童节前夕，中共中央政治局常委、国务院总理温家宝和国务院机关事务管理局幼儿园的孩子们一起，兴致勃勃地观看了由我园组织并演出的《阳光·童心·四季》大型儿童歌舞晚会，并代表党中央、国务院向全国少儿童致以节日的祝贺，向广大幼教工作者致以亲切的问候。全国人大常委会副委员长顾秀莲、国务委员兼国务院秘书长华建敏、国务委员陈至立等也一起观看了演出。
在各级领导的关怀和支持下，国管局幼儿园的各方面建设有了很大的发展。现花园村本部和广源分部共拥有130余名教职员工，25个教学班收托700余名幼儿，两部园区建筑面积达一万平方米左右，环境优美，设施优良、安全。幼儿园领导班子为一名园长，两名副园长；二级管理岗位设园长助理一名，保教、后勤主任各两名，手拉手艺术学校设办公室主任、副主任各一名。幼儿园现有专任教师65名，全部达到大专以上（含在读）学历，保育员31名，保健医3名，炊事员10名，各岗人员均符合岗位要求。目前，幼儿园的主要任务是为国务院机关事务管理局职工的子女提供学前教育服务，并利用余力招收社会各界有识之士子女。
国管局幼儿园现为北京市一级一类幼儿园，海淀区示范幼儿园，北京市社区儿童早期教育示范基地，中央国家机关特级幼儿园。多年来，在国务院机关事务管理局的领导下，在市、区教育部门的指导下，认真贯彻《幼儿园教育指导纲要（试行）》、《幼儿园工作规程》及《幼儿园管理条例》，不断深化教育改革，提出"一切为了孩子，为了一切孩子，为了孩子的一切"的办园宗旨，保教并重，以游戏为基本手段，寓教育于生活及各项活动之中，促进每个幼儿富有个性的发展。同时为给教师的成长搭建平台，在园内积极开展和组织教研活动，促进了教师专业化水平的提升。在教育教学上，幼儿园在民族文化教育和音乐艺术教育上逐步形成了自己的特色。荣获得国家级课题《新世纪中国素质教育研究》子课题："幼儿良好行为习惯养成与适宜教育行为研究"科研成果二等奖。组织骨干教师创作编写的《幼儿发散性思维训练丛书》、《新编幼儿规》、《柯达伊音乐潜能开发课程》等已作为正式出版物出版发行。
国管局幼儿园各项工作和发展前景得到社会各界的重视和有关部门的肯定。先后被评为海淀区幼教系统师德先进集体、国务院机关事务管理局文明单位、国务院机关事务管理局先进党支部、中央国家机关文明单位、中央国家机关文明标兵单位、首都文明单位和中央国家机关"巾帼建功"先进集体、全国"三八"红旗集体。